Biopolym. Cell. 2025; 41(4):275.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.000B27
Молекулярна Біомедицина
Отримання субліній клітин U-251 MG з ектопічною надекспресією двох варіантів мРНК CHI3L1 як модельної системи дослідження ізоформ у гліомагенезі
1, 2Арешков П. О., 1Анопрієнко О. В., 1Шлома А. Р., 1Соломяна К. І., 1, 2Жук О. В., 1, 2Букреєва Т. В., 2, 3, 4Рибачук О. А., 3Нестеренко Ю. А., 1, 2Скрипкіна І. Я.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03143
  2. Інститут клітинної терапії
    просп. Любомира Гузара, 3, Київ, Україна, 03126
  3. Інститут фізіології ім. О.О. Богомольця НАН України
    вул. Академіка Богомольця, 4, Київ, Україна, 01024
  4. Інститут генетичної та регенеративної медицини, ДУ “Національний
    науковий центр “Інститут кардіології, клінічної та регенеративної медицини
    ім. академіка М.Д. Стражеска НАМН України”
    вул. Святослава Хороброго, 5, Київ, Україна, 03151

Abstract

Мета. Отримання субліній клітин гліомного походження U-251 MG, що продукують повнорозмірний та короткий варіанти CHI3L1, з подальшою характеристикою. Методи. Лентивірусна трансдукція клітин U-251 MG, вестерн-блот та RT-qPCR аналіз. Результати. Ми успішно створили сублінії клітин U-251 MG, що продукують повнорозмірний та короткий варіанти CHI3L1; наші результати підтверджують пригнічення секреції CHI3L1-del8ex та демонструють диференціальне таргетування модуляторів мікрооточення (LOX та GUSB) та програми EMT (TGFB1) ізоформами CHI3L1. Висновки. Представлено клітинну модель гліоми для дослідження ролі ізоформ CHI3L1 в експериментах із сокультивування та/або 3D-культивування.
Keywords: CHI3L1, гліобластома, transcriptional isoforms, splicing, differentially expressing genes (DEG), epithelial-mesenchymal transition (EMT)
Повний текст: (PDF, англійською)

References

[1] Johansen JS, Jensen BV, Roslind A, Nielsen D, Price PA. Serum YKL-40, a new prognostic biomarker in cancer patients? Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2006; 15(2):194-202.
[2] Yu JE, Yeo IJ, Han SB, Yun J, Kim B, Yong YJ, Lim YS, Kim TH, Son DJ, Hong JT. Significance of chitinase-3-like protein 1 in the pathogenesis of inflammatory diseases and cancer. Exp Mol Med. 2024; 56(1):1-18.
[3] Zhao T, Su Z, Li Y, Zhang X, You Q. Chitinase-3 like-protein-1 function and its role in diseases. Signal Transduct Target Ther. 2020; 5(1):201.
[4] Recklies AD, White C, Ling H. The chitinase 3-like protein human cartilage glycoprotein 39 (HC-gp39) stimulates proliferation of human connective-tissue cells and activates both extracellular signal-regulated kinase- and protein kinase B-mediated signalling pathways. Biochem J. 2002; 365(Pt 1):119-26.
[5] Stark R, Grzelak M, Hadfield J. RNA sequencing: the teenage years. Nat Rev Genet. 2019; 20(11):631-56.
[6] Johansen JS, Høyer PE, Larsen LA, Price PA, Møllgård K. YKL-40 protein expression in the early developing human musculoskeletal system. J Histochem Cytochem. 2007; 55(12):1213-28.
[7] Shi M, Ge Q, Wang X, Diao W, Yang B, Sun S, Wang G, Liu T, Chan AM, Gao Z, Wang Y, Wang Y. Functional analysis of the short splicing variant encoded by CHI3L1/YKL-40 in glioblastoma. Front Oncol. 2022; 12:910728.
[8] Ren Y, Huang Z, Zhou L, Xiao P, Song J, He P, Xie C, Zhou R, Li M, Dong X, Mao Q, You C, Xu J, Liu Y, Lan Z, Zhang T, Gan Q, Yang Y, Chen T, Huang B, Yang X, Xiao A, Ou Y, Su Z, Chen L, Zhang Y, Ju Y, Zhang Y, Wang Y. Spatial transcriptomics reveals niche-specific enrichment and vulnerabilities of radial glial stem-like cells in malignant gliomas. Nat Commun. 2023; 14(1):1028.
[9] Anopriyenko OV, Areshkov PO, Zhuk OV, Shablii VA, Skrypkina IYa. Integral Regulation Of CHI3L1 Gene And ERVW-1 Locus Expression By Heparin In The Gioblastoma Cell Lines U-87 MG And U-251 MG. Factors Exp Evol Org. 2019; 25:101-5.
[10] Jung H, Kim YE, Kim EM, Kim KK. Alternative splicing of CHI3L1 regulates protein secretion through conformational changes. Genes Genomics. 2025; 47(5):571-9.
[11] Zufferey R, Nagy D, Mandel RJ, Naldini L, Trono D. Multiply attenuated lentiviral vector achieves efficient gene delivery in vivo. Nat Biotechnol. 1997; 15(9):871-5.
[12] Svitina H, Skrypkina I, Areshkov P, Kyryk V, Bukreieva T, Klymenko P, Garmanchuk L, Lobintseva G, Shablii V. Transplantation of placenta-derived multipotent cells in rats with dimethylhydrazine-induced colon cancer decreases survival rate. Oncol Lett. 2018; 15(4):5034-42.
[13] Lu D, Lin Z, Wang R, Chen Z, Zhuo J, Xu L, Pan L, Li H, Yang X, He C, Shen W, Yang M, Li H, Chen H, Tan W, Wei X, Zheng S, Xu X. Multi-omics profiling reveals Chitinase-3-like protein 1 as a key mediator in the crosstalk between sarcopenia and liver cancer. Redox Biol. 2022; 58:102538.